Veiksniai, lemiantys DNR sintezės efektyvumą

Įprastoje DNR, RNR ir nenatūralių nukleino rūgščių sintezėje apsaugos pašalinimo ir sujungimo etapas atlieka lemiamą vaidmenį.

Apsaugos pašalinimo žingsnis yra pašalinti DMT grupę ant kieto pagrindo arba 5' hidroksilo grupę iš ankstesnio nukleozido organine rūgštimi ir atskleisti hidroksilo grupę kitam sujungimo etapui.3% trichloracto rūgštis dichlormetane arba toluene dažniausiai naudojama apsaugos pašalinimo etapui.Trichloracto rūgšties koncentracija ir apsaugos pašalinimo laikas (deblokavimo laikas) lemia galutinių produktų grynumą.Maža koncentracija ir nepakankamas atblokavimo laikas palieka nesureagavusią DMT grupę, dėl kurios sumažėja išeiga ir padidėja nepageidaujamų priemaišų.Ilgas deblokavimo laikas gali paskatinti susintetintų sekų depuriną ir sudaryti netikėtas priemaišas.

Sujungimo žingsnis yra jautrus tirpiklių vandens kiekiui ir oro drėgmei.Vandens koncentracija sintezėje turi būti mažesnė nei 40 ppm, geriau mažesnė nei 25 ppm.Norint išlaikyti bevandenės sintezės sąlygas, nukleino rūgščių sintezė turi būti atliekama žemos drėgmės aplinkoje, todėl savo klientui rekomenduojame naudotiAmiditų ištirpinta įranga, kuris gali ištirpinti miltelių pavidalo arba aliejinį fosforamiditą bevandeniame acetonitrile, kad būtų išvengta sąlyčio su oru.

Veiksniai, lemiantys DNR sintezės efektyvumą5
Veiksniai, lemiantys DNR sintezės efektyvumą4

Kadangi fosforamiditai tirpsta geriau ne vandens sąlygomis, o molekuliniai spąstai adsorbuoja vandens pėdsakus reagentuose ir amidite, reikia paruoštiMolekuliniai spąstai.Rekomenduojame 2 g sietelį 50–250 ml reagentų buteliukams, 5 g 250–500 ml reagentų buteliukams, 10 g 500–1000 ml reagentų buteliukams ir 20 g 1000–2000 ml reagentų buteliukams.

Fosforamiditai turi būti ištirpinami inertinėje atmosferoje, o aktyvatorių reagentai ir acetonitrilas turi būti pakeisti laiku.Uždengimo ir oksidacijos reagentai turi būti naudojami kuo greičiau, atidarytų reagentų galiojimo laikas trumpesnis ir aktyvumas sintezės metu.


Paskelbimo laikas: 2022-09-09